Лабораторія автоматизованих систем та інформаційного забезпечення екологічного менеджменту

---

Лабораторія формування якості поверхневих вод

---

Лабораторія міських і виробничих стічних вод

---

Лабораторія систем і засобів управління промисловими відходами та викидами в атмосферу

---

Лабораторія екологічної гідрогеології

---

Лабораторія гідрофізичних процесів формування якості та заходів з охорони морських вод

---

Лабораторія аналізу стану повітряного басейну, розробки нормативної природоохоронної документації та повітряноохоронних заходів

---

Лабораторія дослідження технологічних викидів шкідливих речовин різних галузей виробництва, проведення еколого-енергетичного аудиту

---

Лабораторія досліджень екологічної стійкості об'єктів довкілля

---

Лабораторія природоохоронних заходів в агропромисловому і паливно-енергетичному комплексах

---

Лабораторія екологічно безпечного водовідведення у водогосподарських системах населених пунктів та господарських об'єктів

---

Лабораторія проблем природних територій та об'єктів особливої охорони

---

Лабораторія радіоекологічної безпеки і радіаційного моніторингу

---

Лабораторія еколого-аналітичних досліджень

---

Лабораторія засобів і методів моніторингу та контролю навколишнього природного середовища

---

Лабораторія систем моніторингу та надзвичайних ситуацій

---

Лабораторія біологічних досліджень та біотестування

---

Лабораторія інженерної екології, оцінки впливу на навколишнє середовище (ОВНС) та екологічної експертизи

---

Лабораторія інженерних методів захисту підземних вод

---